こちらの環境では問題を確認できませんでした。

Opera stable 26.0.1656.60、Windows 7 64bit

現在の Opera には「右 Alt キーでメニューが表示されない」不具合があるので、右Alt + Tab で切り替えるとメニューは表示されないかもしれません。

また、この問題は英語のフォーラムでもいくつか報告されているようです。

Unwanted Opera button menu appears when switching to another application Opera Bug When Using Alt+Tab [alt] How to disable Opera menu being open by pressing alt in opera 20+

しっかりと見ていないのですが、未解決のように見えます。