Элементарно, Ватсон. Причем, MSI ненужна. Один из вариантов. Устанавливаешь Оперу на какой-либо комп как на USB носитель. Она будет портабельной. Может запускаться откуда угодно, профиль пользователя внутри папки Опера. Полученную папку с Оперой пакуешь в самораспаковывающийся архив. В GPO прописываешь запуск этого самого архива. Все, имеешь Оперу на компах пользователей.
Аналогично можно обновлять Оперу. Сохраняя папку с профилем пользователя и заменяя все остальные файлы.