ありがとうございます。修正確認しました。ログインできるようになりました。
英語版フォーラムでもOpera40で同期できないという投稿がありましたが、(forums.opera.com/discussion/comment/15247662)
前バージョンでもAppData以下を全削除するとログインできたので、一からの環境再構築に着手していたところでした。
今回ログイン不具合に対処する際に、Syncのクラウド側のデータをリセットしたりアカウントを作りなおしたりで、
消失してしまったブックマークやスピードダイヤルもあり、ちょっと浅はかなことをしてしまいましたね…。Beta版なのに。