Moim zdaniem tak. Przy czym albo obydwie instalacje albo tylko jedna muszą być w wersji "Samodzielna aplikacja (USB)" - wybiera się w instalatorze przez [Opcje]. Oczywiście przez "Zainstaluj w" trzeba wybrać różne foldery.
"Samodzielnej aplikacji (USB)" nie da się ustawić jako domyślnego programu.
No i jeszcze trzeba umieć dodać skróty do instalacji. Warto im dać różne ikonki.
Czy nie lepiej założyć na laptopie osobne konto użytkownika?